アストラギウス銀河を中心に、戦いは100年続いていた。そんな中、ギルガメス軍のキリコ・キュービィーはある出来事により、味方の軍から追われる身となってしまう。キリコは戦いの日々の中、みずからの運命と対峙することに……。