ロクサスの言葉に顔を背け、キーブレードを向けるシオン。そこにアクセルが武器を投げつけ、シオンとのバトルが始まってしまう。ロクサスは、ふたりを止めようとするが……。仲がよかったはずの3人に、何があったのだろうか。

XIII機関の任務で、ロクサスはさまざまなディズニーワールドをめぐっていく。そして、さまざまな出来事を見聞きし、徐々に自分の存在や、機関に疑問を持ち始めるのだ。彼の疑念は、少しずつ、そして確実に膨らんでいく。

『キングダム ハーツII』でカイリを幽閉するなどの暗躍を見せたサイクス。本作でも、メンバーの行動を探っている。とくにアクセルへの接触が目立つが、いったい何を吹き込んでいるのか？　彼の思惑が、ロクサスたち3人の運命を揺るがす。

先輩であり、教育係でもあるアクセルは、ロクサスのよき理解者。アクセルはふだんの会話の中でもロクサスにいろいろと教えており、その話題は任務と関係のないこともしばしば。女の子、とはシオンのことだろうか？

XIII機関のメンバーを操作するマルチプレイ。本作では、武器を変更することができるのだ。なかには、アビリティが付加されているものも。写真のように、アクセルの武器であるチャクラムにも、さまざまな形状のものが見られる。

ロクサスに課せられるさまざまな任務。その遂行状況を示すものが下画面下部のミッションゲージだ。これは任務の進行状況に合わせて溜まっていき、一定以上になると、任務達成となる。エリアの調査が目的となる任務では、そのエリアに関係する調査ポイントを調べることでミッションゲージが溜まっていく。

『キングダム ハーツ』シリーズでアイテムなどを販売してくれたモーグリショップ。本作では、黒コートを着たモーグリが応対してくれるぞ。メニューには“パネルを購入”、“パネル合成”などの見慣れない文字が並んでいるが？